Nedostatak alfa-linolenske kiseline rezultira smanjenom pretvorbom u eikosapentaenoična kiselina (EPA) kao i dokozaheksaenska kiselina (DHA). Stoga se mogu pojaviti promjene u sastavu staničnih membrana kao i pojačane upalne reakcije. Mogu se pojaviti sljedeći simptomi nedostatka: Oštećen vid, oslabljen zarastanje rana, koža i upala vlasišta, neurološki poremećaji poput depresija, i slabost mišića.
