Kraniomandibularna disfunkcija obično se dijagnosticira na temelju povijest bolesti i sistematski pregled.
Izborni dijagnostika medicinskih uređaja - ovisno o rezultatima povijesti, sistematski pregled, laboratorijska dijagnostika, i obavezno dijagnostika medicinskih uređaja - za diferencijalno dijagnostičko pojašnjenje.
- 3D mjerenje kralježnice - pruža informacije o anatomskim promjenama leđa i kralježnice bez izlaganja zračenju. Snima međusobne odnose kralježnice, zdjelice i leđa, pružajući točnu sliku statike tijela.
- Rendgen pregled lica (okcipitodentalna slika za prikaz maksilarni sinus/ maksilarni sinus i sfenoidalni sinus / sfenoidalni sinus, kao i sljepoočni čeljust zglobova i zigomatične kosti).
- Računalna tomografija (CT) - postupak presjeka slika (Rendgen slike snimljene iz različitih pravaca pomoću računalne analize), u kojoj je glava i vrat regija može biti dobro vizualizirana.
- Magnetska rezonancija (MRI) - računalno potpomognuta metoda presjeka (pomoću magnetskih polja, odnosno bez X-zraka); posebno pogodan za promjene na muskulaturi.
