Tipična gastroenterološka područja liječenja uključuju:
- Refluksna bolest
- Čir na želucu
- Ciroza jetre
- žutica (npr. kod hepatitisa)
- kronične upalne bolesti crijeva (ulcerozni kolitis, Crohnova bolest)
- funkcionalni poremećaji probavnog trakta (kao što je iritabilni želudac, iritabilna crijeva)
- karcinomi probavnog trakta (kao što je rak želuca, rak debelog crijeva)
Za dijagnosticiranje takvih bolesti gastroenterolog koristi različite metode ispitivanja. Tu prije svega spadaju ultrazvučni pregledi trbušne šupljine kao i endoskopski zahvati kao što su gastroskopija (gastroskopija), kolonoskopija (kolonoskopija) i laparoskopija (laparoskopija). Manji zahvati također se mogu izvesti tijekom endoskopije ako je potrebno. Na primjer, gastroenterolog može uzeti uzorke tkiva (biopsija), ukloniti crijevne polipe ili proširiti sužene žučne kanale.