Sinusna aritmija je obično fiziološki i nema dovesti na sekundarne bolesti. Međutim, u vrlo rijetkim slučajevima mogu se pojaviti sljedeće bolesti ili komplikacije zbog uzroka sinusna aritmija.
Kardiovaskularni sustav (I00-I99).
- Infarkt miokarda (srce napad).
- Iznenadna srčana smrt (PHT)
- Skakanje u drugačiji srčani ritam
Psiha - živčani sustav (F00-F99; G00-G99)
- Anksioznost
